Las indicaciones fundamentales son los síndromes miofasciales.
En el caso de la musculatura profunda como el Psoas o el músculo Piriforme la inyección se realiza bajo control radiológico.
Recientemente se ha publicado la posible utilidad de las inyecciones de toxina botulínica en la musculatura craneal para el tratamiento de la cefalea tensional o la migraña: